توبی مگوایر (با نام کامل توبیاس وینسنت مگوایر) در ۲۷ ژوئن ۱۹۷۵ در سانتا مونیکای کالیفرنیا متولد شد. والدین او در زمان تولدش ۱۸ و ۲۰ سال داشتند و ازدواج نکرده بودند. مادرش وندی براون که در زمینه تبلیغات و بازیگری در هالیوود فعالیت داشت، همزمان به عنوان مربی و مدیر برنامههای توبی عمل میکرد. پدرش وینسنت مگوایر آشپز و گاهی کارگر ساختمان بود.
مگوایر برای تمرکز بر بازیگری، دبیرستان را به پایان نرساند اما بعداً مدرک معادل دیپلم (GED) گرفت. او از شش سالگی به عنوان مدل رقص برای نوردمستروم فعالیت میکرد و در تبلیغات مختلفی ظاهر شد. پس از ایفای نقشهای کوچک در سریالهای تلویزیونی، اولین نقش اصلی خود را در کمدی "Great Scott!" (۱۹۹۲) شبکه فاکس به دست آورد که پس از ۹ هفته متوقف شد.
از ویژگیهای شخصیتی مگوایر میتوان به پرهیز از مواد مخدر و الکل، گیاهخواری و علاقه به یوگا اشاره کرد. لئوناردو دیکاپریو دوست صمیمی اوست. مگوایر دو فرزند به نامهای روبی سوئیتهارت و اُتیس توبیاس مگوایر از ازدواجش با جنیفر مایر دارد. نکته جالب اینکه دو برادر ناتنی او، جاپاول و وستون اپ، همان کودکانی بودند که در فیلم مرد عنکبوتی ۲ (۲۰۰۴) ماسک پیتر پارکر را به او پس میدهند.
